Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Borcs8Q9D6Y4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms