Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc7Q9D541 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc7Q9D541 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc7Q9D541 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms