Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc6Q9D4E6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc6Q9D4E6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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