Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms