Protein–RNA interactions for Protein: Q9D411

Tssk4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk4Q9D411 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssk4Q9D411 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssk4Q9D411 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms