Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms