Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt20Q9D312 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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