Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms