Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pramef12Q9D2F1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pramef12Q9D2F1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pramef12Q9D2F1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pramef12Q9D2F1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms