Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krtap5-3Q9D226 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krtap5-3Q9D226 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krtap5-3Q9D226 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krtap5-3Q9D226 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krtap5-3Q9D226 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms