Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms