Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hddc3Q9D114 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hddc3Q9D114 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hddc3Q9D114 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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