Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpsap1Q9D0M1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms