Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc47Q9D024 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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