Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms