Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gtpbp8Q9CY28 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gtpbp8Q9CY28 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gtpbp8Q9CY28 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gtpbp8Q9CY28 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtpbp8Q9CY28 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtpbp8Q9CY28 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtpbp8Q9CY28 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gtpbp8Q9CY28 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gtpbp8Q9CY28 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp8Q9CY28 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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