Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc3Q9CXE6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Xrcc3Q9CXE6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Xrcc3Q9CXE6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Xrcc3Q9CXE6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Xrcc3Q9CXE6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Xrcc3Q9CXE6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Xrcc3Q9CXE6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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