Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CWU4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CWU4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CWU4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms