Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Sycp2Q9CUU3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sycp2Q9CUU3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms