Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms