Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms