Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms