Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PclafQ9CQX4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms