Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm3Q9CQW9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifitm3Q9CQW9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms