Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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