Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms