Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrbp1Q99PL5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrbp1Q99PL5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms