Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms