Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms