Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad54l2Q99NG0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms