Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdac9Q99N13 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms