Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms