Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmp1Q99KU0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms