Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab28Q99KL7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab28Q99KL7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab28Q99KL7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab28Q99KL7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms