Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms