Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms