Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx15Q91WE1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms