Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms