Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf4Q8VI88 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf4Q8VI88 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms