Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crb1Q8VHS2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms