Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms