Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SnrkQ8VDU5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms