Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fyco1Q8VDC1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fyco1Q8VDC1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fyco1Q8VDC1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms