Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RttnQ8R4Y8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms