Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms