Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms