Protein–RNA interactions for Protein: Q8K441

Abca6, ATP-binding cassette sub-family A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca6Q8K441 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abca6Q8K441 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abca6Q8K441 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abca6Q8K441 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abca6Q8K441 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Abca6Q8K441 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Abca6Q8K441 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abca6Q8K441 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abca6Q8K441 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abca6Q8K441 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abca6Q8K441 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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