Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OptnQ8K3K8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms