Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sde2Q8K1J5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sde2Q8K1J5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms