Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FgbQ8K0E8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FgbQ8K0E8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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FgbQ8K0E8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FgbQ8K0E8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FgbQ8K0E8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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FgbQ8K0E8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FgbQ8K0E8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FgbQ8K0E8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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FgbQ8K0E8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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FgbQ8K0E8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FgbQ8K0E8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FgbQ8K0E8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FgbQ8K0E8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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FgbQ8K0E8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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FgbQ8K0E8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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FgbQ8K0E8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FgbQ8K0E8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgbQ8K0E8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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FgbQ8K0E8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgbQ8K0E8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FgbQ8K0E8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgbQ8K0E8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgbQ8K0E8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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FgbQ8K0E8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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FgbQ8K0E8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgbQ8K0E8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgbQ8K0E8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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